Sekirei sind Aliens, die zwar aussehen wie Menschen, aber im Besitz von übernatürlichen Kräften sind. Diese Kräfte können sie nur erhöhen, indem sie ihren Ashikabi finden und sich mit ihm zusammentun. Auf dem Heimweg wird unser Protagonist, der 19-Jährige Minato, der wieder einmal durch die Aufnahmeprüfung für die Uni gerasselt ist, in einen Kampf dreier solcher Sekirei verwickelt. Er weiß zwar nicht, was vor sich geht, doch nimmt er die eine, welche offenbar von den beiden anderen gejagt wird bei der Hand und versteckt sie bei sich zu Hause. Musubi (so lautet der Name des Mädchens) wird Minatos Sekirei und wegen ihr muss er nach Kurzem seine Wohnung räumen, da der Vermieter keine Frauen duldet. Doch durch einen glücklichen Zufall werden die beiden in ein anderes Mietshaus aufgenommen, welches genau Minatos Vorstellungen entspricht. Allerdings sind auch die anderen Mitbewohner ein wenig… merkwürdig…
| # | Titel | Wo anschauen | Sprache |
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| 1 | Stille Anzeichen Quiet Omen |
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| 2 | Der Wind bläst When the Wind Begins to Blow |
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| 3 | Die Antwort des Windes Answer of the Wind |
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| 4 | Die letzte Sekirei The Last One |
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| 5 | Die Flammen-Sekirei The Fire Sekirei |
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| 6 | Worte der Vereinigung Binding Words |
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| 7 | Eine alte Geschichte Faraway Story |
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| 8 | Kusas Spiel Game in the Grass |
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| 9 | Vielerlei Bande A Multitude of Bonds |
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| 10 | Endender Himmel The Ending Sky |
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| 11 | Vorbereitungen für das Festl Festival Preparation |
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| 12 | Turm der Tollerei The Tower of Chaotic Play |
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| 13 | Wahrhaftige Bande The Bond of Truth |
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