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Auf das Weiße Haus wird ein Hacker-Angriff verübt, bei dem der Regierung ein Bekenner-Video zugespielt wird. Trotz des Wunsch des Präsidenten (Kiefer Sutherland) auf Geheimhaltung, kommt das Videomaterial an die Öffentlichkeit.
Die FBI-Agentin Hannah Wells (Maggie Q), die starke Zweifel an der Ausübung des Anschlags durch die verdächtigte Terrororganisation hat, verhört den überlebenden Kongressabgeordneten Peter MacLeish (Ashley Zukerman), der sich an nichts erinnern kann. Bei der Analyse eines Videos wenige Minuten vor dem Anschlag, entdeckt Hannah Unstimmigkeiten.
Der neu ernannte Stabchef Aaron Shore (Adan Canto) erhält eine Akte mit dem Namen „Thomas Kirkman“. Auf wessen Seite steht er?