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In einem geheimen unterirdischen Forschungslabor der Regierung ist es zu einer Reihe von unerklärlichen Explosionen gekommen, zwei bedeutende Wissenschaftler wurden verschüttet. Außerdem ist ein Säuretank geborsten, der das Grundwasser zu verseuchen droht. MacGyver wird zu Hilfe gerufen. Es gelingt ihm zunächst, einige Kollegen der verschütteten Wissenschaftler, unter ihnen Barbara Spencer, zu befreien. Gemeinsam schaffen es die beiden, das Leck im Säuretank abzudichten. Schließlich dringen sie auch zu Dr. Steubens und seinem Kollegen vor. Dort erwartet sie eine böse Überraschung.