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Jahre nach seiner spektakulären Mission durch das Sternentor wird Colonel Jonathan O'Neill von der amerikanischen Regierung um Hilfe gebeten, denn Außerirdische konnten das deaktivierte Sternentor durchdringen und eine Soldatin kidnappen. O'Neill sieht nur eine Möglichkeit. Er muß erneut durch das "Stargate" gehen. Auf der anderen Seite trifft er seinen alten Kollegen Dr. Jackson wieder, der auf dem fernen Planeten zurückgeblieben war. Auch hier hat man mit aggressiven, ungebetenen Besuchern zu kämpfen, denn der tyrannische Außerirdische Ra konnte O'Neills Angriff scheinbar überleben. Doch war es wirklich Ra?