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Ein Jahr später, als die ISDA unter der Leitung von Gillard steht, sind die Dragonauts gespalten und werden gejagt. Da der Gillard-König und Sakaki davon überzeugt sind, dass Drachen gefährlich sind, jagen sie sowohl die ursprünglichen als auch die künstlich geschaffenen Drachen, außer denen, die unter ihrem Kommando stehen. Außerdem gibt es jetzt ein neues D-Projekt. Währenddessen führen Jin, Gio und Toa seit einem Jahr ein normales Leben in einer abgelegenen Stadt. Sieglinde und Kō tauchen unerwartet vor ihrer Tür auf, um den aktuellen Standpunkt der ISDA zu erörtern, und Toa erklärt ihnen, dass Thanatos die Erde nur in Ruhe lassen würde, wenn sie ihre Dracheneier zurückbekommt. Später, als Toa ihre Gefühle für Jin bekräftigt, spürt sie, wie jeder andere Drache auf der Erde, etwas von Thanatos.