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Charlie und das PDB-Team müssen schnellstmöglich die verschwundenen Bomben finden, bevor Mitglieder der Terrorzelle damit einen Anschlag verüben können. Charlie bittet den früheren Berater, Professor Ahmad Ahmadi, um Hilfe. Als Angst und Misstrauen im eigenen Land immer größer werden, gerät Präsidentin Payton wegen ihrer Nähe zur CIA unter Druck und Senator Burke wird für sie zu einer politischen Bedrohung.