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Immer mehr Flüchtlinge schließen sich dem Netzwerk des Mutant Underground an, doch die Gruppe gerät in große Gefahr, denn unter den Neuankömmlingen befindet sich ein Spion, der insgeheim für die Sentinel Services arbeitet. Reed (Stephen Moyer) sucht indes seinen Vater auf, von dem er ein altes Familiengeheimnis erfährt, das noch sehr wertvoll werden könnte.