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Als eine bisher unbekannte Seuche die Menschheit bedroht, will man, wie so oft, die Schuld dafür bei den Mutanten suchen – dabei scheint in Wahrheit Creed, der größte Gegner der Mutanten, dahinter zu stecken. Dann aber stellt sich heraus, dass ein noch mächtigerer Feind verantwortlich für die Seuche ist: Apocalypse, die Kraft, die alles Gute in der Welt zerstören will …