In Yu-Gi-Oh geht es um einen Jungen namens Yugi Muto, der das Milleniumspuzzle von seinem Großvater geschenkt bekommen hatte und es schaffte, dieses nach 8 Jahren zu lösen. Von diesem Zeitpunkt an übernimmt regelmäßig der Geist des Milleniumpuzzles die Kontrolle über Yugi, wenn es um Duel Monsters-Turniere geht, oder es sonst Probleme gibt. Das Kartenspiel "Duel Monsters" ist ein wichtiger Teil der Geschichte. Seine Wurzeln liegen im alten Ägypten, wie auch der Ursprung der sieben Milleniums-Gegenstände, die spezielle Kräfte besitzen. Maximillion Pegasus erfand das Spiel Duel Monsters neu für die heutige Zeit. Sein Konzern, Industrial-Illusions, vermarktet dieses "neue" Kartenspiel. Er fordert Yugi, nach dessen Turnier mit Seto Kaiba, heraus und "lädt" ihn zum Turnier auf seiner Insel "Königreich der Duellanten" ein. Seine Einladung kann Yugi jedoch nicht ausschlagen, denn Pegasus hat Yugis Grossvater entführt... Die meisten westlichen Fassungen der Serie enthalten 12 zusätzliche Episoden "Yu-Gi-Oh! Capsule Monsters", die chronologisch zwischen Episode 198 und 199 angesiedelt sind, jedoch in der Regel erst nach Folge 224 ausgestrahlt wurden. Diese zusätzlichen Episoden wurden von 4Kids produziert.
| # | Titel | Wo anschauen | Sprache |
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| 1 | Ins Spiel gezogen Getting Played |
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| 2 | Einzelkämpfer Divide and Conquer |
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| 3 | Endlich wieder vereint Reunited at Last |
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| 4 | Die Festung der Angst Fortress of Fear |
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| 5 | Im Auge des Sturms Eye of the Storm |
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| 6 | Die Licht-und-Schatten-Prüfung Trial of Light and Shadow |
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| 7 | Rote Augen, schwarzer Fluch Red-Eyes Black Curse |
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| 8 | Frucht der Evolution Fruit of Evolution |
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| 9 | Die finsteren Fünf (1) The Fiendish Five: Part I |
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| 10 | Die finsteren Fünf (2) The Fiendish Five: Part II |
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| 11 | Der wahre König (1) The True King: Part I |
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| 12 | Der wahre König (2) The True King: Part II |
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