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Zu Beginn der Zusammenarbeit des S.H.I.E.L.D.-Teams wurde Mike Peterson von den Agenten neutralisiert. Seitdem gehört er zu S.H.I.E.L.D. und versucht, die Rekorde von Captain America zu brechen – bislang jedoch erfolglos. In seinen Superkräften sieht Coulson dennoch eine Bereicherung für das Team, da keiner der Agenten selbst Superkräfte besitzt. Skye findet heraus, dass Raina für den Gefängnisausbruch von Edison Po verantwortlich ist. Dem Team gelingt es, das mysteriöse Projekt „Centipede“ in Oakland zu lokalisieren. Doch die Gruppe ist auf den Angriff vorbereitet und empfängt die Agenten mit einer Horde Extremis-Kriegern …