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Ein Supercomputer reißt das Kommando über die Enterprise an sich. Die Enterprise soll an einem militärischen Übungsmanöver teilnehmen, in dessen Rahmen auch der neuartige Supercomputer M5 an der Enterprise getestet werden soll. Dieser ist nicht nur in der Lage, jeden Teil des Schiffes ohne menschliches Zutun zu kontrollieren, sondern verfügt auch über enorme taktische Intelligenz und besitzt überdies sogar kreative Fähigkeiten, die denen eines Menschen nachempfunden sind. Zunächst scheint der Computer seine Arbeit auch hocheffizient zu erledigen und überzeugt in dem Übungsmanöver. Doch als die computergesteuerte Enterprise einen unbeteiligten Frachter zerstört, ordnet Captain Kirk die sofortige Deaktivierung des Computers an. Dessen Erbauer Dr. Daystrom sieht dafür jedoch keinen Grund und verteidigt seine Erfindung selbst dann noch, als diese ein Mitglied der Besatzung tötet. Es erscheint unmöglich, die Kontrolle über die Enterprise wiederzuerlangen, doch die Zeit drängt, denn der Computer beginnt damit, weitere Föderationsschiffe anzugreifen.