Das schwarze Ei Resonance

Quon, die in einem komatösen Zustand war, öffnet ihre Augen, nachdem Itsuki und Sayoko das Labor verlassen haben. Ayato geht mit Futagami spazieren, der ihm ein Bild von Maya als Anführerin der Mulianer zeigt. Quon, die aus dem Labor vermisst wird, entkommt mit Reika, die durch ihre Erinnerungen direkt mit ihr verbunden ist. Plötzlich wird ein Dolem ausfindig gemacht und Ayato wird losgeschickt, um danach zu suchen. Als der Dolem das RahXephon verschlingt, greift Quon durch ihre Stimme nach einem schwarzen Ei, das dem Ei, das Ayato in Tokyo Jupiter gefunden hat, sehr ähnlich zu sein scheint, aber sie muss noch erweckt werden. Ayato kann dann den Dolem passieren, da er ihn in zwei Hälften schneidet.